智能交通系统保护交通数据安全和隐私的方法有很多，包括加密技术、访问控制、数据匿名化等。
首先，采用强大的加密技术对交通数据进行加密存储和传输，确保数据在传输和存储过程中不被窃取或篡改。同时，确保只有经过授权的人员才能访问解密后的数据，采用访问控制技术数据的访问权限，防止未经授权的人员获取到敏感数据。
其次，对交通数据进行匿名化处理，即在保证数据可用性的前提下，剔除掉可能泄露个人隐私的信息，如身份证号、车牌号等个人敏感信息，以保护交通参与者的隐私。
另外，建立健全的安全管理制度和流程，加强对系统的监控和审计，及时发现和应对安全威胁和漏洞，保障交通数据的安全性和隐私性。
在实际操作中，可以参考一些成功案例，如新加坡的智能交通系统。新加坡采用了多层次的安全措施，包括数据加密、严格的访问控制和数据匿名化等措施，有效保护了交通数据的安全和隐私。同时，新加坡也通过立法和监管，规范了交通数据的收集、使用和分享，保障了公民的隐私权益。
综上所述，智能交通系统保护交通数据安全和隐私的关键在于加强数据加密、访问控制和数据匿名化，建立健全的安全管理制度和流程，并依法规范数据的收集和使用，以确保交通数据的安全和隐私。